叶无尘带着玄门代表队取得斗魂大赛的胜利，圣灵教抓捕因为淘汰离开的队伍。
大赛结束之后，玄门张三元等人带着三大帝国的参赛代表队离开日月帝国，顺手解决圣灵教，回到极北城。
统一斗罗大陆之后，神界破裂，唐三带着他的嫡系投靠魔渊，大陆上的居民和魂师、魂兽邪魔化，幸存者全部加入玄门，进入灵元玄界。
玄门六殿齐出，反攻魔渊，消除魔气之后，纳入灵元玄界。